A história do game começa com a prisão de Vendra Prog após uma perseguição intergalática, onde Ratchet e Clank se ofercem para escoltar a criminosa até o Vartax Detention Center.
Porém, após uma grande fuga de Vendra Prog nos confins da galáxia, Ratchet e Clank ficam perdidos num setor abandonado. E é ali, nos confins do espaço, que eles descobrem um evento interdimensional que ameaça todo o universo.
O jogo vai manter suas características, como o bom humor presente em toda a série, além de armas malucas e exploração de vários planetas.